Otaku Girls est un shojo pour le moins étonnant. Décrivant le quotidien de Rumi, une fille fan de manga yaoi (genre mettant en scène des relations amoureuses entre hommes), l'histoire accumule les quiproquos, les traditions du cosplay, et tous les clichés sur le mondes otakus. Un manga surprenant, sans aucun doute. Et lorsqu'une ancienne copine d'Abe, Momose Tsugumi, vient faire la zizanie dans tout ce petit monde, il devient très compliqué de suivre la situation. C'est surtout Rumi qui en fera les frais, étant de plus en plus confuse dans ses sentiments. Cela lui vaudra de ne plus fréquenter Abe pendant un moment, avant que le destin (?) en décide autrement. Le couple Matsui/Chiba n'est pas non plus au mieux de sa forme, ce qui pousse Chiba à penser qu'une relation avec Abe serait plus simple. Essaye t-il de faire de l'humour ? Quoiqu'il en soit, Asai et Matsui sont toujours à fond dans le trip yaoi et ont décidé de créer un site Internet sur le sujet.

L'heure des examens a sonné et Asai n'a pas encore la tête à ça. Au lieu de faire une rédaction en anglais, elle dessine un manga, ce qui lui provoquera d'office une sanction. Face à cela, Abe se révolte, et va jusqu'à pousser son professeur, ce qui lui vaut un renvoi d'une semaine du lycée. De leur côté, Chiba et Matsui décident enfin d'assumer leur relation. Chiba a d'ailleurs envie d'aider Abe, et créé pendant son absence, un comité de soutien. Ce dernier parviendra t-il enfin séduire Asai ? Il serait temps, mais ce dernier a choisi d'utiliser son temps libre en devenant assistant mangaka. Une manière détournée de se rapprocher d'Asai ? Celle-ci travaille avec Matsui sur un dôjin pour le prochain Comiba, un festival haut en couleurs. Et comme à l'accoutumée, rien ne va se dérouler comme prévu ...