Mario et Luigi  reviennent donc dans une formule assez inchangée : le but sera une nouvelle fois, de sauver la Princesse Peach. La routine pour les plombiers en somme. Seulement voilà le méchant n'est plus Bowser mais des Shroobs, des monstres assez ignobles venus d'une autre planète. Le rapport avec le titre ? J'y arrive : Peach a été enlevée alors qu’elle essayait une nouvelle machine à remonter le temps. Sans se soucier des dangers, les frères Mario sautent dans le vortex interdimensionel et vont bien se retrouver, face à eux mêmes, bébés ! 

Alpha Dream a donc ressorti du placard Baby Mario et Baby Luigi, l'occasion de créer une équipe de folie. Evidemment la théorie faisant état qu'il serait très dangereux de rencontrer son double dans le passé ou dans le futur (cela créerait  selon la légende, une grave instabilité temporelle) est ici totalement balayée  Nintendo et cela va être l'occasion de réaliser des mouvements spéciaux et mettre en commun les capacités des personnages pour éliminer les obstacles en travers de leur route. (cf vidéo dans la fiche). Toutefois rassurez-vous, vous pourrez également contrôler le tandem du présent euh du futur, enfin les Mario et Luigi que vous connaissez dans certaines phases précises.