Nintendo avait initialement prévu de développer la Virtual Console pour la Switch. La fonction de console virtuelle était connue sur des consoles telles que la Wii et permettait d'acheter et de télécharger des jeux classiques individuels. Ceci est rapporté par LuigiBlood , qui a évalué les e-mails internes de Nintendo et iQue. Avec l'introduction de Nintendo Switch Online, le concept a changé : au lieu d'acheter des jeux individuels, les abonnés ont accès à des collections de classiques via des applications spéciales. Des documents internes et des courriels de Nintendo et de sa société partenaire iQue révèlent que le développement d'une console virtuelle pour la Switch a débuté en 2015. Le nom de code du projet était « Clipper », qui impliquait également M2. Les tests incluaient des jeux comme Final Fantasy 1 et 3 , Mega Man 2-6 et d'autres classiques de la NES. Les particularités de la console virtuelle prévue étaient, par exemple, un mode CRT censé simuler l'allumage d'un téléviseur CRT, y compris les bruits typiques. Une fonction de jeu en réseau était prévue, dans laquelle les contrôleurs basculeraient automatiquement entre quatre joueurs maximum. Des options de communication supplémentaires telles que des emojis et des messages prêts à l'emploi tels que « merci », « sry », « plz » et « cya » ont été envisagées.

Le projet de console virtuelle a été abandonné début 2017 et remplacé par L-Classics, l'actuel Nintendo Switch Online. Selon des discussions internes, la raison était une analyse coûts-avantages : il y avait des coûts de test élevés pour les émulateurs de console virtuelle sur chaque nouvelle plate-forme et on craignait des critiques de la part des joueurs qui devaient acheter des jeux plusieurs fois lorsqu'ils changeaient de plate-forme. De plus, Nintendo souhaitait rendre de nombreux jeux disponibles rapidement, à moindre coût et sur le long terme. Finalement, Nintendo Switch Online a été créé, permettant aux utilisateurs d'accéder à des collections entières de jeux classiques et à des mises à jour régulières avec de nouveaux titres. De plus, Switch Online est compatible à long terme avec les futures plateformes Nintendo.