Des envahisseurs venus d’un autre monde attaquent sans crier gare, déchaînant sur la race humaine des formes de vie mécaniques. Face à cette menace insurmontable, l’humanité se voit contrainte d’abandonner la planète et de se réfugier sur la Lune.  Les humains développent une armée de soldats androïdes afin de vaincre la horde mécanique, mais ne parviennent malheureusement qu’à ralentir son avancée. Afin de sortir de cette impasse, une nouvelle espèce d’androïdes est envoyée dans la mêlée : le groupe d’intervention YoRHa.  Dans les territoires abandonnés, la guerre entre machines et androïdes fait rage. Une guerre qui va bientôt dévoiler les mystères longuement oubliés de ce monde…