1942. L'histoire de l’équipage d’un navire de guerre ultramoderne, dépêché en Amérique du Sud pour assurer la sécurité de ressortissants japonais, qui se retrouve en pleine guerre du Pacifique et qui doit faire face à un dilemme : participer ou non à la guerre quitte à changer le cours de l’histoire. Une opération contre les bases anglaises situées en Inde est lancée, mais les Anglais sentent venir le piège et envoient leurs avions à la rencontre des Japonais. Le constat est sans appel, les troupes nippones sont rapidement décimés. Maintenant, les avions s'approchent des bateaux japonais dont la défense est bien maigre. Que va donc faire le Mirai ?

Zipang est un manga qui se déroule en réalité durant l'an 200X, où la force d'auto-défense Japonaise, participe à des manœuvres avec l'OTAN dans le Pacifique. Après avoir subit d'étranges phénomènes climatiques durant la nuit, le navire se retrouve en Juin 1942, à la veille de la bataille de Midway. Coincé dans cet espace temps, l'équipage devra faire des choix, et intervenir ou non pour modifier l'histoire. L'armée japonaise se retrouve en possession de la bombe atomique, un sacré paradoxe historique. Le lieutenant Kogâmi est alors en proie au doute, et le Yamato poursuit sa route sans vraiment savoir ce qu'il va advenir du futur. La bombe étant désormais armée, le choc promet d'être terrible dans la région, et risque d'éliminer de nombreux croiseurs américains. Le capitaine Kusaka offre alors un choix cornélien au capitaine Kadomatsu ... mais la situation va vite leur échapper. Blessé à la jambe, Kadomatsu demande au Mirai de couler le Yamato au risque de modifier pour de bon l'avenir. Mais même s'il ne prenait pas cette décision, le capitaine doute revoir son époque un jour : Devenu une anomalie temporelle, son existence même est menacé dans cette nouvelle réalité. Contre toute-attente, son salut viendra peut être du clan opposé. Kadomatsu tient son avenir (son passé ?) entre ses mains.